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谐波检测算法是并联型有源电力滤波器的关键技术之一。而直流侧电压的控制关系到有源电力滤波器的稳定工作。本文以同步坐标变换检测算法和递归的离散傅立叶变换检测算法为例详细介绍了两类谐波检测算法，并分析了在负载波动的暂态过程中它们对直流侧电压控制的影响。通过仿真分析和实验结果验证了在负载波动的暂态过程中，基波提取算法将会造成直流侧电压的较大波动，而谐波直接提取算法对直流侧电压的控制基本无影响。