氨肽酶、β-葡糖苷酶、脂酶分别是微生物分泌的降解蛋白质、碳水化合物及脂类的胞外酶,2011年武汉市30余个湖泊及太湖和巢湖沉积物的研究结果表明,有机质含量分别与氨肽酶、β-葡糖苷酶、脂酶活性显著正相关,且三者均分别与脱氢酶活性(DHA)显著正相关,而DHA是表征微生物潜在呼吸耗氧量的重要指标,因此,微生物胞外酶驱动的活性有机质的分解当为底层营养释放的重要促进因素；此外,间隙水铵态氮浓度亦与DHA显著正相关,故蛋白质的分解的产物亦能导致底层缺氧,从而促进沉积物磷的释放；最后,蛋白质和多糖均能诱导微生物分泌碱性磷酸酶,从而促进有机磷的水解与无机磷的释放。总之,蛋白质自身及其分解产物可通过厌氧解吸附与酶促水解等机制可促进沉积物磷的释放,而微生物胞外酶则为驱动上述过程的关键因素。