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炮制是毒性中药减毒的常用手段之一，发酵法作为传统的炮制方法亦可用于毒性中药的减毒。传统发酵主要采用杂菌发酵工艺，这种工艺由于整体过程难以控制，存在杂菌污染等问题，因此无法保障其质量和用药安全。纯种发酵为现代生物工程技术，可掌握发酵过程中代谢变化的规律，反映出碳源、氮源的利用和pH值、菌体浓度和产物浓度等参数之间的相互关系，发现其工艺控制中存在的问题，并能判断发酵终点，缩短发酵周期，解决杂菌污染。本文就现代纯种发酵工艺替代传统杂菌发酵工艺，运用于毒性成分分别为生物碱、内酯物质、苷类化合物、毒蛋白、马兜铃酸、蒽醌、鞣质和重金属等八类毒性中药炮制减毒的可行性、可靠性做一论述。