猪圆环病毒2型SYBR-Green 1实时荧光定量PCR检测方法的建立

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目的:建立一种快速、灵敏检测猪圆环病毒2型的SYBR-Green 1实时荧光定量PCR方法。方法:根据已报道的猪圆环病毒2型ORF2基因组序列,设计并合成1对引物。通过常规PCR扩增猪圆环病毒2型ORF2基因,将鉴定正确的ORF2基因片段克隆入pTG19-T载体中,转化大肠杆菌JM109,经PCR及测序鉴定后得到阳性重组质粒,作为标准品模板建立SYBR-Green 1荧光定量PCR标准曲线和溶解曲线,并做灵敏性试验、特异性试验和重复性试验。结果:结果表明,标准曲线循环阈值与模板浓度呈良好的线性关系,溶解曲线特异,相关系数为0.9988;将已计算出拷贝数的重组质粒10倍梯度稀释,在荧光定量PCR仪上得出所能检出的最低拷贝数为1拷贝/25μL(反应体系浓度),比常规PCR结果高100倍;将猪圆环病毒2型、猪细小病毒、猪繁殖与呼吸综合症病毒、猪伪狂犬病毒阳性样品的DNA作为模板,进行荧光定量PCR检测,结果显示,只有PCV2有荧光信号,其他无荧光信号,说明该方法有很好的特异性;选取10-5倍稀释的重组质粒为模板,连续扩增6次,结果表明,每次扩增的误差不到1个循环,可见荧光PCR检测方法具有较高的可重复性,从而保证了不同样品间检测结果的可靠性和稳定性;对16份疑似PMWS的病料进行SYBR-Green1荧光定量PCR检测,16份完全阳性;常规PCR扩增,检测到13份阳性,说明荧光定量PCR比常规PCR灵敏度高。结论:成功建立了检测猪圆环病毒2型的SYBR-Green 1荧光定量PCR方法,与普通PCR相比,该方法具备许多优点:灵敏度高,可检测到1拷贝/25μL(反应体系浓度)的模板量;特异性强,与其他猪源性病毒无交叉反应;线性范围宽,标准曲线循环阈值与模板浓度呈良好的线性关系,相关系数达0.99881所需时间短,从核酸提取至检测完成,仅需3h左右,且该方法实行完全闭管式操作,从根本上杜绝了常规PCR扩增产物污染和假阳性的问题。此方法为早期诊断猪圆环病毒2型起到很好的指示作用,也为下一步研究猪圆环病毒2型在猪体内的分布、致病机理及组织嗜性的研究奠定了基础。
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