【摘 要】
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本文基于克雷伯杆菌的全基因组序列、大肠杆菌的全基因组序列及酿酒酵母的全基因组序列,通过相对同义密码子使用度(RSCU)和相对同义密码子使用频率(RFSC)参数,确定它们各自的偏好密码子与高频密码子。结果表明,这三者的偏好密码子都为25个,且都偏好以TAA为终止信号。可知,克雷伯杆菌具有其独特的密码子偏性,与物种的亲缘关系类似,该偏性跟大肠杆菌比较差异较小,而与酿酒酵母差别极大,密码子优化时可依据它
【机 构】
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华侨大学化工学院,泉州362021 厦门大学化学化工学院,厦门361005
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本文基于克雷伯杆菌的全基因组序列、大肠杆菌的全基因组序列及酿酒酵母的全基因组序列,通过相对同义密码子使用度(RSCU)和相对同义密码子使用频率(RFSC)参数,确定它们各自的偏好密码子与高频密码子。结果表明,这三者的偏好密码子都为25个,且都偏好以TAA为终止信号。可知,克雷伯杆菌具有其独特的密码子偏性,与物种的亲缘关系类似,该偏性跟大肠杆菌比较差异较小,而与酿酒酵母差别极大,密码子优化时可依据它们各自的偏性进行有目的的同义密码子替换;另外可知,高频密码子集合是偏好密码子集合的子集,相对偏好密码子而言,通常数量更少、特异性更高的高频密码子,其对异源表达中密码优化问题的参考价值可能更高。
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本文从一株高产纤维二糖酶的黑曲霉中分离到总RNA,进一步获得mRNA。根据黑曲霉纤维二糖酶基因序列设计合成一对特异性引物,采用PCR和RT-PCR技术扩增得到全长2583bp的纤维二糖酶基因。将已克隆到的纤维二糖酶基因插入表达载体pSE420,进一步转入大肠杆菌BL21宿主细胞,筛选得到一株可产纤维二糖酶的重组细菌。该研究结果为进一步构建纤维素酶高产菌株奠定了基础。
本文以大肠杆菌表达的重组人促红细胞生成素(rhEPO)为模型蛋白,研究了精氨酸在还原变性的rhEPO的复性过程中的作用。探讨了精氨酸对不同蛋白有不同的抑制聚集能力的作用机制。
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