海洋青鳉鱼转录组测序及PFOS暴露引起的基因表达变化解析

来源 :中国化学会第28届学术年会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:kongxf04
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  海洋青鳉鱼(Oryzias melastigma)是新型海水鱼模式物种,具有广泛运用的潜力,但基因信息的缺乏限制了它的运用.我们采用新一代Illumina RNA-seq技术,共获得145,394条unigenes,N50为565 bp.经过注释,我们获得了多条信号通路途径基因信息,为运用该鱼模型进行分子毒理学研究提供了良好的基础.全氟辛烷磺酸(PFOS)是一种广泛分布于海水中的新型持有性有机污染物,其生态毒性日益受到重视.我们以获得的转录组信息为基础,采用数字基因表达谱技术(DGE),分析了鱼卵经PFOS暴露4天后转录水平的表达变化,分别有325和349个基因表达上调和下调.这些差异表达基因组成的信号通路参与神经系统、酯类和蛋白质代谢等生理过程.定量PCR技术研究表明ATP合成酶表达显著下调,解偶联蛋白(UCP-2)的表达显著上升,导致线粒体提供ATP的能力下降.综上,本研究首次获得了海洋青鳉鱼转录组信息,为该鱼的运用提供了基因信息基础.我们还在转录组学水平研究了PFOS引起的鱼卵基因表达变化,有助于解析PFOS的分子毒理机制.
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