【摘 要】
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目的：开发适用于花椒(Zanthoxylum)植物的SSR 分子标记特异性引物.方法：对2 种花椒属植物花椒(Zanthoxylum bungeanum)和竹叶花椒(Zanthoxylum armatum)分别进行转录组测序.基于转录组测序得到的EST序列,进行SSR 位点识别、引物设计和合成.在两种花椒EST-SSR 引物中分别随机挑选60 对引物,利用12 对不同的花椒植物样本对引物进行验证.
【机 构】
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四川农业大学 林学院,成都 611130 中国中医科学院 中药所,北京 100700
【出 处】
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2017年中国药学大会暨第十七届中国药师周
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目的：开发适用于花椒(Zanthoxylum)植物的SSR 分子标记特异性引物.方法：对2 种花椒属植物花椒(Zanthoxylum bungeanum)和竹叶花椒(Zanthoxylum armatum)分别进行转录组测序.基于转录组测序得到的EST序列,进行SSR 位点识别、引物设计和合成.在两种花椒EST-SSR 引物中分别随机挑选60 对引物,利用12 对不同的花椒植物样本对引物进行验证.采用琼脂糖凝胶电泳和聚丙烯酰胺银染电泳实验分别验证其特异性和多态性.结果：花椒的60 对引物中,有46 对成功扩增出特异性条带,扩增效率76.67％；竹叶花椒的60 对引物中,有41 对扩增出特异性条带,扩增效率68.33％.条带大小在100-300bp,主要集中在150-250bp.再次随机从第一轮筛选出的引物中选取花椒和竹叶花椒的SSR 引物各15 对,一共30 对,选取6 个花椒样本进行多态性评价,用聚丙烯酰胺银染电泳进行多态性条带的检测.花椒的15 对引物中,13 对产生了多态性条带,多态率86.67％；竹叶花椒则有14 对产生了多态性条带,多态率93.33％.结论：基于花椒属植物转录组测序结果 的EST-SSR 分子标记开发的引物,在花椒属植物中具有较明显的特异性和通用性,能为以后花椒属物种的鉴定与区分提供可靠的分子标记工具.
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