耐盐性是影响作物的在盐碱地生长和产量的重要性状。大豆是中度耐盐作物,从大豆种质资源中筛选耐盐材料对于耐盐基因挖掘、耐盐新品种的培育具有重要意义。在前期的研究中我们建立了高效的大豆苗期耐盐性鉴定方法,发现NaCl胁迫下大豆茎、叶中Na~+含量与大豆苗期的耐盐性高度相关(刘光宇等,2011;姜静函等2013)。利用筛选到的高度耐盐材料与盐敏感材料配置杂交组合,将大豆苗期耐盐基因定位到大豆3号染色体,通过精细定位,图位克隆了大豆苗期耐盐基因GmSALT3,该基因编码一个阳离子/质子交换蛋白,被定位于内质网上(Guan et al.,2014)。利用分子标记辅助选择,培育了3组近等基因系材料,发现耐盐基因GmSALT3可以同时调控近等基因系材料在盐胁迫下地上部Na~+和Cl~-的积累,并且在盐碱地条件下降低耐盐近等基因系荚和种子中Na~+和Cl~-的含量,与盐敏感近等基因系材料相比,耐盐材料具有更高的百粒重和产量。说明该基因对保持大豆在盐碱地条件下的产量具有重要作用,同时也发现大豆出苗期的耐盐并非由GmSALT3控制(Liu et al.,2016)。根据基因变异开发功能标记,对我国不同年度育成大豆品种(系)进行检测,发现该基因在大豆育种的不同阶段受到不同的选择,导致不同等位变异在各生态区域分布特点各异。功能性分子标记开发及耐盐基因等位变异的不同分布规律解析,为分子标记辅助耐盐大豆的选择及分子设计育种奠定基础。