水稻穗腐病(rice spikelet rot disease,RSRD)是我国各水稻种植区发生为害严重的水稻穗部病害,近年来在河南信阳稻区的发生为害也呈现出逐年蔓延和加重的趋势。水稻穗腐病为害稻穗,造成谷粒腐坏、变色、结实率降低或不实、稻米畸形等,不仅影响产量、降低稻米品质,威胁水稻生产,同时病原菌还会产生毒素,对食用者的安全和健康构成危害。本研究在2016—2018年从河南省信阳市平桥区、狮河区、罗山县和光山县采集水稻穗腐病样本,通过病原菌分离纯化、形态学和TEF1基因序列分析鉴定,明确了信阳地区水稻穗腐病的病原菌种类及优势种群。从信阳地区水稻穗腐病样本中共分离到279株病原真菌,以镰孢菌Fusarium spp.为主,分离频率达50.18%,其中包括藤仓镰孢菌复合群F.fujikuroi species complex、厚垣镰孢菌复合群F.chlamydosporum species complex、禾谷镰孢菌复合群F.graminearum species complex、F.incarnatum-equiseti species complex、尖孢镰孢复合群F.oxysporum species complex,分离频率分别为19.36%、12.90%、11.1%、3.58%和3.23%。细极链格孢Alternaria tenuissima的分离频率相对较高,达10.75%;黑孢属和弯孢属病原菌各2种,即球黑孢菌Nigrospora sphaerica(9.68%)和稻黑孢N.oryzae (4.66%)、棒弯孢Curvularia clavata (6.45%)和新月弯孢C.lunata(6.09%);水稻胡麻斑病菌稻平脐蠕孢Bipolaris oryzae在穗腐病害材料中的分离频率为6.81%;在谷粒上形成蓝绿色霉层的草酸青霉Penicillium oxalicum分离频率为5.38%。镰孢菌属分类系统复杂,不同复合群中具体种的鉴定仍需要进一步的研究。