【摘 要】
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目的:探讨在中国四川盆地流行的结核分枝杆菌群体遗传学特征.
方法:对收集自四川盆地(重庆和四川地区)的413株Mtb行长序列多态性(LSP)谱系鉴定;采用x2检验分析不同谱系Mt
【机 构】
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101149首都医科大学附属北京胸科医院北京市结核病胸部肿瘤研究所国家结核病临床实验室温州医科大学检验医学院生命科学学院浙江省模式生物技术与应用重点实验室
【出 处】
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中国防痨协会2016年全国学术大会
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目的:探讨在中国四川盆地流行的结核分枝杆菌群体遗传学特征.
方法:对收集自四川盆地(重庆和四川地区)的413株Mtb行长序列多态性(LSP)谱系鉴定;采用x2检验分析不同谱系Mtb在人群中的分布差异.对上述菌株行15位点数目可变串联重复序列(VNTR)基因分型,评价各位点的分辨力.构建N-J树分析其系统进化;构建最小跨度树以模拟群体菌株的遗传结构;采用分子方差分析该地区不同谱系菌株的遗传分化;采用贝叶斯模型计算最近共祖年代.
结果:通过LSP可将413株Mtb菌株分为两大谱系,其中北京谱系占56.2％(232/413);欧美谱系占43.8％(181/413).两谱系Mtb在人群中的分布(性别、年龄、民族及耐药性)差异无统计学意义(P＞0.05).北京谱系Mtb的N-J树呈放射状分布,最小跨度树中有72.4％(168/232)的菌株被划分到同一"克隆复合群".欧美谱系Mtb的N-J树呈枝状分布,最小跨度树中呈现出多个"克隆复合群".北京谱系Mtb在重庆和四川两地区间有显著的遗传分化(FST=0.01891,P＜0.05),而欧美谱系Mtb遗传分化不显著(FST=0.00519,P＞0.05).欧美谱系Mtb中最大克隆复合群(共71株)的最近共祖年代为723年(95％CI:517～946年).
结论:北京谱系和欧美谱系Mtb在四川盆地以"互相对抗"形式流行;两谱系Mtb遗传分化存在差异;欧美谱系Mtb的侵入可能与一次历史事件(约720年前的一次战争)有关.
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