在体外将长牡蛎蛋白进行模拟肠胃消化。本实验采用UPLC-Q-TOF-MS/MS和Mascot搜索引擎对肠道消化阶段释放的多肽进行序列鉴定。并通过其对凝血酶抑制活性测定,结果显示牡蛎肽的抗凝血酶活性在4 h达到最高35.80%。然后利用生物信息学工具Discovery Studio 2017软件对PDB数据库上的凝血酶结构进行优化筛选。最终筛选出凝血酶结构(5ZJY)与长牡蛎消化肽分子对接。本文采用CDocker算法预测了潜在抗凝血酶多肽及其抗凝血酶活性的机制。计算得到14种潜在的抗凝血酶多肽,其-CDocker能量得分均高于hirudin(181.491)。与凝血酶抑制剂序列相似的牡蛎肽有8条。并比较了潜在抗凝血酶肽与凝血酶在"S1口袋"的结合位点。此外,还鉴定出6个含有RG/RGD的肽,可被凝血酶水解。因此,在模拟胃肠消化过程中释放的牡蛎肽可以通过两种方式抑制凝血酶:凝血酶活性位点的抑制剂和竞争性底物,这揭示了牡蛎肽在人体消化系统中潜在抗凝血酶活性。