【摘 要】
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真核生物基因组中转座子元件(TE)的移动常会导致嵌合转座子的产生(即某一转座子插入到基因组中现有的其它转座子元件中)。我们利用已有的真核生物转座子数据库,来检测其中的
【机 构】
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西南大学农学与生物科技学院,教育部南方山地农业工程研究中心; 江西农业大学,教育部直属作物生理学、生态学和遗传育种重点实验室; 昆士兰大学豆类综合研究中心和农业与食品科学学院;
【基金项目】
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国家“863”项目(编号:2011AA10A104);现代农业产业技术体系项目(编号:CARS-13)
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真核生物基因组中转座子元件(TE)的移动常会导致嵌合转座子的产生(即某一转座子插入到基因组中现有的其它转座子元件中)。我们利用已有的真核生物转座子数据库,来检测其中的嵌合转座子,并分析他们的特征及其在真核生物基因组中的可能作用。在11,329条转座子序列中,共检测到802个转座子插入到690个宿主转座子中。重复序列与嵌合转座子的发生有关,可能是转座子插入的热点区域。与嵌合转座子有关的基因多定位于细胞器中,结合核酸和蛋白质。这些嵌合转座子多参与代谢过程,编码与转座和整合有关重要的酶。真核生物基因组中的嵌合转座子可能与基因组的扩大负相关,同时嵌合转座子对丰富基因表达和调控的多样性具有重要意义。
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