Particle-Mesh-Ewald(PME)算法在GPU上的实现

来源 :中国化学会第28届学术年会 | 被引量 : 0次 | 上传用户：YNiit562552379

【摘要】

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　　分子动力学模拟(Molecular dynamics,MD)是分子模拟的一类常用方法.作为CPU的加速设备,近年来,图形处理单元(GPU)为提高MD计算能力提供了新的可能.静电效应广泛存在于生

【作者】

：

石静刘文志李晓霞郭力

【机构】

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中国科学院过程工程研究所多相复杂系统重点实验室,北京,100190

【出处】

：

中国化学会第28届学术年会

【发表日期】

：

2012年期

【关键词】

：

PME 算法分子动力学模拟图形处理单元 Molecular 生物现象静电作用静电效应

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　　分子动力学模拟(Molecular dynamics,MD)是分子模拟的一类常用方法.作为CPU的加速设备,近年来,图形处理单元(GPU)为提高MD计算能力提供了新的可能.静电效应广泛存在于生物现象的各个方面,对其精确模拟是MD重要组成部分.Particle-Mesh-Ewald(PME)方法是公认的精确处理静电作用的算法之一.

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