【摘 要】
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本研究运用CUSP、CodonW、CHIPS软件程序分析茶树肌动蛋白基因CsActin1的密码子偏性,与茶树基因组及其它8种植物基因组比较.结果显示,相对密码子使用度(RSCU)与茶树基因组比较,只有6种氨基酸密码子偏性一致,且没有如茶树基因组一样偏好使用A/T结尾的密码子;密码子使用频率与玉米等8种植物的基因组进行比较,差异较大的密码子个数在单子叶植物和双子叶植物间区别不大;茶树与其它9种植物的
【机 构】
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湖南省农业科学院茶叶研究所,湖南长沙 410125
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本研究运用CUSP、CodonW、CHIPS软件程序分析茶树肌动蛋白基因CsActin1的密码子偏性,与茶树基因组及其它8种植物基因组比较.结果显示,相对密码子使用度(RSCU)与茶树基因组比较,只有6种氨基酸密码子偏性一致,且没有如茶树基因组一样偏好使用A/T结尾的密码子;密码子使用频率与玉米等8种植物的基因组进行比较,差异较大的密码子个数在单子叶植物和双子叶植物间区别不大;茶树与其它9种植物的肌动蛋白基因基于RSCU的聚类结果与基于CDS序列的聚类结果在大类上均将双子叶植物和单子叶植物分别聚类,能在一定程度上反映物种间的亲缘关系.
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