论文部分内容阅读
从正常笼养树鼩腹部的脂肪转录组数据开发SNP分子标记.检测了6只动物共计274278568条unigene(总长度43138417bp)序列信息后,在262980条unigene(5.75％)中共发现SNP位点262980个,SNP发生频率为1/27bp,其中转换(transition)177562个,颠换(transversion)85509个.在所有变异类型中,A/G和C/T发生频率最高,分别达33.85％和33.66％.为进一步对得到的SNP所在基因功能进行分析,将包含SNP位点的262980条unigene通过参比序列进行注释,并对其进行GO分类、COG分类注释和代谢通路注释(KEGG pathway),结合已有研究,筛选到1 187个可能脂肪转录组中的可能与脂肪形成和代谢有关的SNP标记.