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回顾“九五”以来“中药材规范化种植研究”课题的进展，中药材质量评价中的科学问题突显出来。文中对中药材的有效性和毒性的核心问题进行阐述，对评价对象的质量稳定性进行分析，介绍了“中药材规范化种植研究”中的SOP制定具有与时俱进的性质，对质量评价的DNA指纹谱、蛋白质组指纹谱、中药材次生代谢产物指纹谱的建立方法进行了阐述，对中药材质量的未来发展进行了展望。