黔东南地方栽培稻芒性状基因组关联分析3

来源 :全国农业生物化学与分子生物学第十五届学术研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:valerianforever
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  芒是禾本科植物稻(Oryza sativaL.)果实上的细芒刺(http://baike.baidu.com),水稻的芒性状与驯化过程密切相关,黔东南地方栽培稻群体具有丰富的芒性状特征,是研究芒的理想材料.本研究通过第二代基因组测序技术,建立了60个黔东南山区特色栽培稻的简化基因组(SLAF-seq),根据314,065条SLAF标签,开发获得35,434,302个SNPs分子标记.基于SNPs分子标记,进一步采用GLM算法对黔东南栽培稻的芒性状进行全基因组关联分析(GWAS).基因注释信息基于Goff等(2002)报道的水稻基因组 (382 Mb;RGAP v7.0;http://rice.plantbiology.msu.edu/index.shtml).
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