基于蛋白质相互作用网络的甲型流感病毒宿主因子预测

来源 :第十二届全国计算(机)化学学术会议 | 被引量 : 0次 | 上传用户：manacewj

【摘要】

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本文对甲型流感病毒(IAV)-人类相互作用从蛋白质层面进行了网络分析.研究发现,IAV强烈倾向于与具有特定拓扑特征和生物功能的人类蛋白质结合.基于这些拓扑特征和生物特征,应

【作者】

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赖燕华[1]李占潮[2]陈丽丽[3]戴宗[3]邹小勇[3]

【机构】

：

中山大学化学与化学工程学院,广州,510275

【出处】

：

第十二届全国计算(机)化学学术会议

【发表日期】

：

2013年期

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本文对甲型流感病毒(IAV)-人类相互作用从蛋白质层面进行了网络分析.研究发现,IAV强烈倾向于与具有特定拓扑特征和生物功能的人类蛋白质结合.基于这些拓扑特征和生物特征,应用支持向量机结合遗传算法建立了识别模型.基于留一法交叉验证,总预测精度为71.4％.将该模型用于9706个人体蛋白质,最终从人体相互作用组中识别了1418个新的靶标基因,其中部分基因已经被证实在IAV感染中起了重要作用.

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