甘蓝型油菜BAN、F3H和TT19基因的eQTL定位研究

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黄烷酮3-羟化酶(flavonone 3-hydroxylase,F3H)、BANYULS(BAN)基因编码的花青素还原酶(Anthocyanidin reductase,ANR)和TTl9编码的谷胱甘肽转移酶(g|utathioneS-transferases.GST)是类黄酮途径中的3个关键酶,在花青素和原花青素的合成和转运起重要作用。本研究利用重组自交系F7代家系(GH06×油研2号选系)花后30天种子对上述3个基因家族的表达量进行检测,利用QTL作图方法对其进行了eQTL分析,取LOD临界值为2.0,共检测到二十个相关的eQTL位点,分别位于LG07、LG08、LG10、LG11、LG12、LG16、LG20、LG22八个不同的连锁群上,单位点解释遗传表型变异的4.09%~8.95%。在LG8和LGl6连锁群上检测TTl9和BAN基因及BAN和F3H基因相关的eQTL分别与同一个标记E4M8/a和H022L18-2紧密连锁。根据全基因组BLASTN比对,BAN基因在白菜中有两个不同的成员,其中一个成员位于白菜A01染色体上F3H的两个基因分别位于A03和A09两条染色体,而TT19的两个基因分别位于A02和A10两条染色体。其中A09染色体上的4个eQTL连锁标记200 kb侧翼序列不仅在白菜和甘蓝中具有很好的共线性关系,而且它们分别与拟南芥第1和第5染色体也具有较好的共线性,能够用于候选基因分析,为深入研究甘蓝型油菜黄籽性状等复杂性状形成的分子机理和调控机制奠定了基础。
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