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代谢组学(metabolomics)旨在研究生物体或组织甚至单个细胞的全部小分子代谢物成分及其动态变化，是系统生物学中非常重要的一个环节，而且距表型最接近，对揭示植物基因功能及代谢网络具有极大的推动作用。近年来我们建立了基于色谱-质谱联用仪(GC-TOF/MS、GC-QQQ/MS及UHPLC-Q-TOF/MS)的植物代谢组学分析平台。对水稻一个重组自交系群体种子低温萌发时的代谢组进行分析，结合数量性状位点(QTLs)定位分析，定位了大量代谢物QTLs (mQTLs)，这将有利于揭示水稻种子低温萌发QTLs的代谢调控机制。