本研究从上海、南京、武汉和青岛四个城市的生活污水处理厂采集了未经处理的生活污水样本,采用PCR-测序的分型方法,研究了样本中人兽共患的隐孢子虫虫种、蓝氏贾第虫和比氏肠微孢子虫在基因型和亚型水平上的分布特征.为了阐明动物宿主对这些病原体的贡献,也对只感染动物的艾美尔球虫进行了基因分型.在386份样本中,隐孢子虫、贾第虫、微孢子虫和艾美尔球虫的阳性率分别达到56.2％、82.6％、87.6％和80.3％,高阳性率使得传播动态研究的开展成为可能.分型结果显示,可以感染人的虫种/基因型包括人隐孢子虫、火鸡隐孢子虫、贾第虫的基因亚型A:Ⅱ和比氏肠微孢子虫的基因型D,在污水样本中所占比例最高.在样本中还发现普遍存在啮齿类动物中常见的隐孢子虫和艾美尔球虫虫种,因此判断人兽共患的比氏肠微孢子虫基因型D除来自人外,还有可能来自于啮齿类动物.同样,在样本中发现的只感染禽类的贝氏隐孢子虫和艾美尔球虫虫种,表明样本中可以感染人和禽类的火鸡隐孢子虫的宿主来源可能既有人源又有禽源.以上结果表明,人-人的传播为隐孢子虫病、贾第虫病和微孢子虫病在我国这四个地区的主要传播途径.同时,在上海和武汉的样本中人隐孢子虫的基因亚型分布存在很大差别,提示人隐孢子虫在我国不同地区人群中的流行传播可能具有地域性.而且,本研究结果也表明,对城市生活污水中病原体的分子监测是了解某些疾病在当地传播动态的一种快速有效的方法.