本文进行了牛粪沼气发酵过程中产甲烷菌群落结构的RFLP分析。我国奶牛养殖近年来得到了极大的发展，但与之俱来的是产生了大量的奶牛粪便，据统计每头奶牛日产鲜牛粪约30公斤，牛尿和冲洗废水150公斤，奶牛粪便已成为我国农村环境主要污染源之一。沼气发酵是奶牛粪便最有应用前景的处理工艺之一，在使奶牛粪便无害化的同时，产生的沼液沼渣可作为有机肥料，沼气可作为能源。但是由于奶牛粪便有机质浓度和难降解的纤维素含量高，作为原料进行沼气发酵时，普遍存在调试启动慢，运行过程不稳定，易出现酸化和不产气或产气率低等问题，这已经在很大程度上制约了沼气发酵在奶牛粪便处理中的应用。由于产甲烷菌是专性严格厌氧菌，培养条件苛刻，生长缓慢，依靠分离纯化的方法分析沼气发酵过程中产甲烷菌的种群演替，不仅耗时长，而且还无法反映一些未可培养的产甲烷菌种群，因此无法全面、快速、准确的反映沼气发酵过程中产甲烷菌的演替情况。随着分子生物学的发展，建立在微生物核糖体小亚基(16S rRNA)序列分析基础上的分子系统发育分析方法快速、方便，不依赖于培养，可以突破传统培养方法的局限性，直接在基因水平上进行分析。