【摘 要】
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近年来随着高通量测序技术的飞速发展,使得通过SNP与数量性状之间的关联分析来实现基因的精细定位成为可能.这项技术不仅在人类疾病应用方面实现了巨大突破,其他经济动物全基因组关联研究也飞速发展.相比于单标记分析,全基因组单倍型分析为研究提供了一个新的思路.一些结果表明,一个单倍型可能组成一个大等位基因,从而在数量性状的表型变化中起着重要作用.本研究基于illumina BovineSNP50 (54K
【机 构】
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中国农业科学院北京畜牧兽医研究所,中国农业科学院肉牛研究中心,农业部畜禽遗传资源与利用重点开放实验室,北京100193
【出 处】
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中国畜牧兽医学会信息技术分会2013年学术研讨会
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近年来随着高通量测序技术的飞速发展,使得通过SNP与数量性状之间的关联分析来实现基因的精细定位成为可能.这项技术不仅在人类疾病应用方面实现了巨大突破,其他经济动物全基因组关联研究也飞速发展.相比于单标记分析,全基因组单倍型分析为研究提供了一个新的思路.一些结果表明,一个单倍型可能组成一个大等位基因,从而在数量性状的表型变化中起着重要作用.本研究基于illumina BovineSNP50 (54K)和BovineHD (770K)两款芯片数据,同时采用基于单标记和单倍型的全基因组关联分析两种方法对内蒙古乌拉盖管理区的942头育肥肉牛的里脊重以及金钱键两个重要的经济性状开展了全基因组关联分析的研究.研究结果表明,这两种方法同时定位到了相近的区域,一些潜在的显著SNP位点和相关基因被找到.
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