西藏自治区作为牦牛的主要产区之一,其数量占全国牦牛总数的30％,由于其特殊的地理条件和生态环境,形成了特有的地方品种和类群,牦牛遗传资源十分丰富.牦牛遗传多样性和系统分类研究一直是牦牛科学研究的重点和热点之一,但由于受地理、气候、文化等因素的影响,加之牦牛采取放牧散养,样品采集较为困难.因此,对西藏牦牛的研究仅限于少数几个品种或类群,绝大多数牦牛类群尚未有正式的命名,对其遗传谱系、亲缘关系及分类地位的研究尚属空白,人们知之甚少.本研究对巴青牦牛、工布江达牦牛、江达牦牛、嘉黎牦牛、康布牦牛、帕里牦牛、斯布牦牛、桑日牦牛、桑桑牦牛、错娜牦牛、丁青牦牛、类乌齐牦牛、隆子牦牛、聂荣牦牛、日多牦牛、仲巴牦牛、申扎牦牛等17个类群共170个个体的mtDNA CO Ⅱ全序列进行测定,使用Kimura-2-Parameter双参数模型和邻近法(NJ)构建分子系统树,探讨西藏牦牛的遗传多样性和类群间的系统进化关系,为西藏牦牛资源的合理保护利用提供理论依据.结果表明:西藏17个牦牛类群的mtDNA COII全序列长度均为684bp，基因间没有内含子，起始密码子为AUG(ATG)，终止密码子为TAA，编码227个氨基酸。T,C,A和G4种核苷酸的平均比例分别为28.5%,22.7%,34.4%和14.5%;G+C平均含量为37.2%,A+T平均含量为62.9%,具有一定的碱基偏倚性。