宁夏2010年肠道病毒71型进化分析

来源 :第二届传染病防控基础研究与应用技术论坛 | 被引量 : 0次 | 上传用户:yl2590
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  目的:分析2010年宁夏回族自治区手足口病(Hand-Foot-and-Mouth Disease,HFMD)患者中肠道病毒71型(Enterovirus 71,EV71)分离株基因特征。方法:收集宁夏2010年手足口病患者粪便,咽拭子和疱疹液标本,进行病毒分离培养和real-time RT-PCR检测后,对鉴定为EV71毒株的VPl编码区进行核苷酸序列测定分析。结果:共收集各类标本994份,分离获得EV71 225株,对所有EV71毒株的VPI编码区基因进行序列测定,选择其中53株进行序列分析。宁夏分离株与A、B、C型基因型代表株核苷酸同源性分别为80.0~81.5%、82.4~84.7%和87.2~99.1%;氨基酸同源性分别为93.9~94.3%、96.3~97.6%和97.6~100%,与C4a亚型同源性最高为95.6~99.1,在系统发生树上,这53株毒株与C4基因型代表株聚为一簇,属于C4亚型中的C4a分支,而且提示至少存在4条病毒传播链。结论:2010年EV71的C4a亚型在宁夏有较广泛的流行,是宁夏流行的绝对优势基因亚型,其流行存在多条传播链。
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大约10-15%的大肠杆菌在染色体复制过程中会形成染色体二聚体。大肠杆菌染色体编码的酪氨酸整合酶XerC和XerD作用于染色体复制终点区28bp的染色体dif序列,以同源重组的方式将染色体二聚体解离为单体。编码霍乱毒素的噬菌体CTXΦ以位点特异的方式整合入霍乱弧菌染色体,但其基因组中不含有任何整合酶基因,其整合需要细菌染色体编码的XerC和XerD整合酶,且整合位点与大肠杆菌dif序列相似。Xer
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