Trim5α基因由于受到来自逆转录病毒的强烈选择作用,在不同物种中能够以物种特异性的方式限制逆转录病毒.Trim5α蛋白中氨基酸的改变会对抗逆转录病毒的活性产生重要影响,因此研究Trim5α基因中的正选择作用的位点对于理解该基因的进化及后续的功能性实验有重要作用.本研究采用RT-PCR和RACE方法从红面猴(Macaca artoides)的血液中克隆了Trim5α基因全序列,其全长2,853 bp；CDS区域为1,494 bp,编码497个AA；3′端1,260bp,5′端序列99 bp.结合NCBI中下载的其它灵长类动物Trim5a基因,进行正选择的氨基酸位点分析,发现有25个AA位点受到强烈的正选择作用,其中Coiled-coil及Spry结构域有18个位点,这表明Coiled-coil及Spry结构域是该蛋白与逆转录病毒的衣壳蛋白作用的重要区域.通过比较不同猕猴动物Trim5a密码子使用的差异发现,红面猴在Trim5a密码子使用偏好上与恒河猴最相似,其次是藏酋猴、食蟹猴,而与地中海猕猴差异最大.通过密码子适应指数(CAI)的值可以预测蛋白的表达水平,CAI值越高蛋白表达水平越高.我们通过分析恒河猴、藏酋猴、食蟹猴、地中海猕猴和红面猴的CAI值,推测除地中海猕猴外,其他4类猕猴Trim5a的表达水平一致,而地中海猕猴Trim5a的表达水平略低.另外我们通过比较红面猴Trim5α基因密码子与大肠杆菌的K12菌株密码子使用的差异,发现有29个密码子,尤其是编码精氨酸的密码子存在较大差异,这或许对于红面猴Trim5α原核表达中密码子的改造有重要意义.