【摘 要】
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分别以丰香草莓(Fragaria×ananassa Duch.cv.Toyonoka)果实大绿果期和转色期两个发育阶段cDNA为试验组(Tester)和驱动组(Driver),利用抑制差减杂交(SSH)技术构建了正反两个cDNA文库,分别包含516和524个克隆.通过EST测序、序列拼接后,共获得707条uniESTs,其中正反向文库分别为369和338个uniESTs,包括123条Contigs
【机 构】
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中国农业科学院郑州果树研究所,郑州 450009
【出 处】
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第七届中国草莓大会暨第八届中国草莓文化节
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分别以丰香草莓(Fragaria×ananassa Duch.cv.Toyonoka)果实大绿果期和转色期两个发育阶段cDNA为试验组(Tester)和驱动组(Driver),利用抑制差减杂交(SSH)技术构建了正反两个cDNA文库,分别包含516和524个克隆.通过EST测序、序列拼接后,共获得707条uniESTs,其中正反向文库分别为369和338个uniESTs,包括123条Contigs和584条Singletons.在Nt库比对中有537条uinESTs与已知基因匹配,占比75.95％；在Nr库比对中有509条序列有匹配蛋白,占比71.99‰有193个uniESTs能进行GO功能注释,其中细胞组分被注释了315次、分子功能被注释了332次、生物过程被注释了409次.uniESTs的功能分析显示绿果期文库多数与细胞营养生长、分裂、早期胚胎发育、营养运输有关,转色期文库主要与刺激代谢物形成、色素合成、果实软化、种子成熟有关,与草莓果实发育和成熟生理过程基本一致.
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