化肥促进农业生产发展的同时也带来了环境污染、土壤板结、土壤肥力下降、盐渍化加剧和农作物品质下降等一系列问题,对农业的可持续发展构成了严重的挑战.为了减少化肥的使用,本研究从植物根际筛选得到一株能够促进植物生长并改善土壤环境的菌株S3-1,通过形态特征观察、生理生化实验、16S rRNA序列同源性分析将其鉴定为解淀粉芽孢杆菌(Bacillus amyloliquefaciens).通过发酵技术将其与辅助材料进行多次复配,制成以S3-1为主要功能菌的生物有机肥,并在上海浦东番茄实验基地以基肥和追肥的方式进行大田实验.结果 表明：1)与对照组相比,在施用了生物有机肥后番茄果实的产量增加了63％,可溶性蛋白、可滴定酸、可溶性糖、维生素C的含量分别提高了49.36％、9.40％、6.82％、71.66％,而硝酸盐的含量降低了13.6％；2)生物有机肥的施用分别使土壤中脲酶、蔗糖酶、酸性磷酸酶、多酚氧化酶、过氧化氢酶的活性提高了约31.50％、44.69％、31.03％、27.27％和4.32％；3)通过传统的平板涂布法和PCR-DGGE技术对土壤微生物进行分析,结果显示施肥组根际土壤细菌的多样性和丰富度均得到了明显提高,微生物群落结构相对于对照组更加合理；4)在使用生物有机肥4个月后,土壤中有机质、速效磷、速效钾的含量都得到了提高,而可溶性盐含量和pH值有所降低.说明所研制的生物有机肥能够增加番茄产量,提升番茄果实品质,提高土壤生物活性,促进有机养分转化,缓解土壤盐渍化程度.这些研究为解淀粉芽孢杆菌S3-1在农业生产的实际应用奠定了基础.