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自从2006年首次爆发以来双胞旋沟藻(Cochlodiniumgeminatum)赤潮在珠江口水域多次发生。2009年在珠海沿岸爆发的双胞旋沟藻赤潮覆盖面积高达300 km2,持续时间长达20多天。我们在该赤潮爆发期间对该海域的环境因子特征和浮游植物群落结构进行了现场监测和分析。赤潮水团的叶绿素、溶解磷、氨氮和水温显著高于非赤潮水体,但亚硝氮、硝态氮、溶解态氮和氮磷比显著低于非赤潮水体。盐度和硅酸盐在两个水团中没有显著差异。浮游植物群落主要由硅藻和甲藻组成。甲藻平均占浮游植物总密度的73.21%,赤潮水团中甲藻的比例(89.71%)显著高于非赤潮水团(49.08%)。