鸭疫里默氏杆菌是危害我国乃至世界养鸭业的主要细菌病原体之一,由于鸭疫里默氏杆菌血清型复杂,不同血清型交叉保护力弱。因此现阶段,对于鸭疫里默氏杆菌的防控仍然以抗生素为主。红霉素为大环内酯类抗生素,除了对革兰氏阳性菌、革兰氏阴性菌具有一定的抑制作用,对某些螺旋体、支原体、衣原体等也有良好的作用,因此在生产一线得到广泛应用。由于红霉素长期大量、超范围的使用,使得细菌对红霉素的耐药率不断增高。耐药性监测结果表明,虽然大部分地区鸭疫里默氏杆菌临床分离株仍保持对红霉素的敏感性,但是鸭疫里默氏杆菌红霉素耐药株的分离率逐年提高。对于鸭疫里默氏杆菌红霉素耐药机制的研究,国内外文献多集中于参考其他种类细菌红霉素耐药基因(erm),进行同源基因的流行病学调查或基因环境分析,尚无对红霉素耐药菌株与红霉素敏感菌株进行整体、全面的差异分析。因此,本研究以鸭疫里默氏杆菌红霉素敏感株Yb2为模型,采用人工诱导方法,通过红霉素浓度梯度增加,获得了鸭疫里默氏杆菌Yb2红霉素耐药型,采用链特异性转录组分析及荧光定量PCR方法,对野生型Yb2及人工诱导的红霉素耐药型进行转录组差异比较。结果显示,随着红霉素浓度的增加,野生型Yb2及人工诱导的红霉素耐药型差异基因聚类呈现不同模式,在红霉素浓度较低的环境压力下,鸭疫里默氏杆菌主要以上调水解酶表达水平来抵抗抗生素的选择压力;随着红霉素浓度的增加,鸭疫里默氏杆菌差异基因聚类主要表现为细胞膜相关基因以及细胞代谢通路等。这一结果表明,细菌对红霉素的抵抗,不仅为单个耐药基因的上调表达,随着选择压力的增大,细菌对红霉素的适应性更是细菌单个基因、代谢通路、生理学特征的综合能力反应。