【摘 要】
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目的 用基因芯片技术研究高(H)转移卵巢癌细胞系(HO-8910PM)和正常卵巢上皮(C)基因表达谱差异基因及其在染色体拷贝数变异的相关性.方法 利用人类SNP图谱分析芯片10K 2.0 (Affymetrix Inc.,Santa Clara,CA)检测高转移卵巢癌染色体拷贝数变异,用标准化的U133A基因芯片(Affymetrix Inc.,Santa Clara,CA)检测高转移卵巢癌和正常
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目的 用基因芯片技术研究高(H)转移卵巢癌细胞系(HO-8910PM)和正常卵巢上皮(C)基因表达谱差异基因及其在染色体拷贝数变异的相关性.方法 利用人类SNP图谱分析芯片10K 2.0 (Affymetrix Inc.,Santa Clara,CA)检测高转移卵巢癌染色体拷贝数变异,用标准化的U133A基因芯片(Affymetrix Inc.,Santa Clara,CA)检测高转移卵巢癌和正常卵巢上皮基因表达谱差异,并利用生物信息学方法对检测结果进行相关性分析.筛选不稳定的染色体片段和差异表达基因,用荧光原位杂交技术和RT-PCR技术进行验证.结果 发现有3518个SNP位点有染色体拷贝数扩增或缺失,与U133A基因芯片分析有相同差异表达(Signal Log Ratio[SLR]≥1,SLR≤-1)的有379个SNP位点,共385个基因(有6个SNP位点发现各有2个基因).这些SNP位点染色体拷贝数扩增≥3的有240个,缺失≤1的有139个.在染色体定位分析发现所有差异表达基因散在分布于各条染色体上,但以3号染色体最多有34个(占8.8％),其次是2、9、10、1和11号染色体分别有33个(8.6％)、28(7.3％)、27(7.0％)、25(6.5％)、24(6.2％),6和12号染色体分别有23个(6.0％),4和5号染色体分别有22个(5.7％).这10条染色体占总数67.8％.而差异表达的基因发生在染色体短臂(q)上有241个(62.6％).从表达差异的385个基因分子功能分类看,属于酶和酶调控子活性基因最多(99个,占25.7％),其次是信号传导活性基因(54个,占14.0％).第3类是核酸结合活性基因(50个,占13.0％).第4类蛋白结合活性基因(36个,占9.4％).以上4大类共占基因总数62.1％.还有功能未知的基因有64个,占16.6％.结论 肿瘤的转移是多基因共同作用的结果.4大类(酶和酶调控子活性、核酸结合活性、蛋白结合活性、信号传导活性)差异表达基因是我们今后研究卵巢癌转移相关的重要基因.1、2、3、4、5、6、9、10、11和12号染色体是值得关注的转移相关基因位点.
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