多位点可变数目串联重复序列分析方法在布氏菌病监测中的应用

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布氏菌病(Brucellosis,简称布病)是由布氏菌属细菌侵入机体所引发的传染-变态反应性人兽共患的传染病。近年来布病疫情迅速回升,发病率连续16年增长,愈演愈烈;在中国已经是严重的公共卫生问题之一,预防和控制人畜布病成为一项破在眉婕的重要工作。确认布氏菌种(型)对于疫情判断及流行病学溯源分析极为重要。传染病暴发呈现的新特点对疾病监测信息报告管理和突发公共卫生事件应对提出新的挑战。因此,开展布病暴发流行的追踪、溯源是布病预防控制技术支撑体系中急需解决的问题。根据宿主偏好、致病力及流行病学特性,布氏菌属分为9个种,分别是羊种(共3个型)、牛种(共8个型)、猪种(共5个型)、绵羊副睾种、犬种、沙林鼠种、两种新的海洋哺乳动物种(鲸、鳍)和田鼠种。传统的生物型鉴定只能鉴定到种(型),无法对菌株进行溯源分析。一些低分辨率的分子分型方法如PCR产物限制性片段长度低多态性(PCR-RFLP)、肠杆菌基因间重复序列(ERIC-PCR)、基因外重复回文序列(REP-PCR)、随机扩增多态性DNA(RAPD-PCR)和扩增片断长度多态性分析(AFLP)在分子流行病学中应用价值又十分局限。由于布氏菌属种间DNA同源性高达90%,急需一种高分辨力的分型方法用来提供疾病传播模式和分子流行病学信息,多位点序列分析(MLST)和脉冲场凝胶电泳(PFGE)应运而生;然而这些方法都存在有限的菌株间区分能力,无法对某一疫区间进行菌株流行病学关联追踪调查。多位点可变数目串联重复序列分析(Multiple-Locus Variable-number tandem-repeat Analysis,MLVA)是一个基于PCR技术的分型方法 ,该方法通过区分基因组上多个具有多态性串联重复序列位点(VNTR)的重复数来区分菌株。串联重复数不同的核酸片段经位于串联重复的两端引物扩增,通过琼脂糖电泳、测序或毛细管电泳确定扩增产物大小,进而确定串联重复数。此方法分辨率高、重复性好、快速、简便,可用于流行病学溯源分析。本研究对17株羊种菌、19株牛种菌、18株猪种菌和10株犬种菌株进行MLVA分析,并确定了相关暴发菌株,揭示了共同传染来源。本研究通过建立适于省级疾病防控系统监测实验室使用的标准化布氏菌分子分型技术,建立流行菌株基因型数据库,结合流行病学信息,确定暴发流行范围,为寻找传染源和传播链提供技术支撑,为提高和扩展布病防控能力提供新模式。
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