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本文比较了琼脂糖电泳、CE(UV/LIF)和Qsep100电泳对20&1000bp, 50-3000bp两组混合双链DNA样品的分子量测定。结果表明:琼脂糖电泳法可以同时对两组样品进行分离，但只能进行半定量检测，且20&1000bp样品出现条带丢失。常规CE-LIF和CZE-UV条件下，不能对碱基对范围较宽的两组DNA样品进行高效分离。Qsep100电泳则可在5min内实现全部双链DNA的基线分离，并能给出模拟的琼脂糖电泳图，可方便地与琼脂糖电泳进行结果比较。Qsep100电泳不需对双链DNA预先染色，分离速度快，分离效率高，耗时短，在线LED-IF检测灵敏度高。