研究发现双生病毒基因组具有很快的变异速度,特别是菜豆金色花叶病毒属病毒,无论是在种间或种内均具有丰富的遗传多样性。Ge等对中国番茄黄化曲叶病毒（Tomato yellow leaf curl China virus,TYLCCNV）种群遗传结构及变异研究发现,TYLCCNV在本氏烟、番茄等寄主上具有较高的变异水平和丰富的遗传多样性,其种群具有与RNA病毒相似的准种特征。烟草曲茎病毒（Tobacco curlyshoot virus,TbCSV）是从云南表现曲茎症状烟草上分离到的双生病毒科菜豆金色花叶病毒属的一个新种。TbCSV单独接种可以在寄主植物上引起典型症状,病毒本身即可在田间维持病害的发生,是一个不完全依赖卫星的病毒。为了弄清TbCSV是否存在类似TYLCCNV的准种结构及变异水平,为解读双生病毒的遗传进化轨迹提供科学依据,本研究将TbCSV分离物Y35伴随卫星分子（Y35β）的侵染性克隆接种心叶烟,同时以自然感染TbCSV的田间烟草和胜红蓟为材料,从分子克隆出发,对TbCSV的种群结构、变异水平及碱基突变类型进行了分析。将Y35+Y35β接种心叶烟,分别在接种后60d和120d采集植株叶片,从中获得TbCSV试验种群Y35-60X和Y35-120X,并从田间烟草和胜红蓟样品中获得2个TbCSV自然种群YN46和YN12。对所获得的TbCSV种群的遗传结构和突变水平进行分析,结果表明,TbCSV种群具有丰富的遗传多样性,但在不同寄主中种群变异没有明显差异。其中,Y35-60X种群23个克隆中11个克隆发生变异,突变克隆百分比为47.8%,共有14个核苷酸位点发生突变,突变频率为6.0×10^-4;而Y35-120X种群22个克隆中有12个克隆发生变异,突变克隆百分比为54.5%,共16个核苷酸位点发生突变,突变频率为7.2×10^-4;YN46种群24个克隆中13个克隆发生变异,突变克隆百分比为54.2%,有23个核苷酸位点发生突变,突变频率为9.4×10^-4;而YN12种群24个克隆中9个克隆发生变异,突变克隆百分比为37.5%,有15个核苷酸位点发生突变,突变频率为6.1×10^-4。进一步对TbCSV种群碱基突变类型进行分析,发现TbCSV种群的碱基突变类型均为碱基替换,且主要是碱基T突变为碱基C。