病原菌与宿主蛋白质之间的相互作用参与着病原菌所有的感染过程。研究病原菌与宿主之间的相互作用能够我们全面理解细菌病的致病机理。尽管目前这个领域已有少量的研究,但仍有待于全面的系统鉴定病原菌与宿主之间的蛋白质相互作用过程。在本研究中,我们建立了一种名为基于亲和层析的表面蛋白质组学(Affinity Chromatography-based Surface Proteomics;ACSP)的新研究方法,该方法将亲和层析技术和shotgun蛋白质组学技术(LC-MS/MS)相结合,可以用来大尺度系统的研究病原与宿主之间的相互作用。为了完成ACSP实验,我们以锚定了天然的Hep-2细胞表面分子的树脂为诱饵,用来从S.suis表面蛋白中捕获潜在的互作分子。随后,我们利用LC-MS/MS技术从捕获物中鉴定出40个潜在的表面互作蛋白,这些蛋白中有3个蛋白已在前期的研究中被证实。我们选取了8个重要的表面互作蛋白,并证实了其与Hep-2细胞的粘附作用。另外,3个新鉴定的表面互作蛋白的重组蛋白以及多克隆抗体能够显著的抑制S.suis与Hep-2细胞的粘附过程,因此这3个蛋白极有可能在S.suis与Hep-2细胞的相互作用过程中发挥着重要的作用。通过使用这个例子,我们证实了ACSP技术是一个非常有价值的研究病原菌与宿主相互作用的实验工具。