通过DNA测序,分别对5个中国黄牛品种的MHC-Ⅱ类基因DQB和DRB<,3>外显子2及其上游调控区序列进行分析。共检测到DQB*exon2等位基因127种,其中新等位基因87个;DRB<,3>*exon2等位基因259种,其中新等位基因131个,等位基因的分布具有品种特异性。 各等位基因之间存在大量多态位点,统计分析表明:发生非同义替换的多态位点均主要分布在抗原结合位点对应的编码序列中,且一些多态位点的氨基酸组成在品种间具有显著差异。在DQB和DRB<,3>基因的URR中均存在与基因表达调控有关的调控元件,包括W box、X box、Y box、CCAAT box以及类TATA box。在BoLA-DQB-URR中,调控元件W box、X box、Y box以及类TATA box是多态的,CCAAT box是保守的,调控元件之间也分布着多态位点。在BoLA-DRB-URR中,调控元件都是保守的,只是在调控元件之间零散的分布着一些多态位点。另外,这2个基因的URR与结构基因之间的对应关系均具有可变性。