论文部分内容阅读
本研究以线粒体COⅠ基因和D-Loop区序列作为分子标记,分析中国南海弓背青鳉的遗传多样性。基于mt DNA COⅠ基因分析结果:136条COⅠ基因序列(579bp)中,T、C、A和G碱基的平均含量分别为32.8%、25.7%、24.6%、16.9%,A+T的含量(57.4%)明显高于C+G的含量(42.6%);COⅠ基因序列中共发现77个变异位点,碱基转换/颠换比值(TS/TV)为5.42;平均核苷酸差异数、核苷酸多样性、单倍型多样性及单倍型数分别为9.709、0.01677、0.967、52;AMOVA分析揭示群体间遗传分化比群体内分化明显;基于COⅠ基因序列构建的进化树绝大多数个体按照采样点进行聚类。基于mt DNA D-loop分析结果:141条D-loop区序列(507bp)中,T、C、A和G碱基的平均含量分别为27.6%、18.6%、31.9%、21.8%,A+T含量为59.5%,明显高于C+G含量(40.4%);D-loop区序列中,共检测到37个变异位点,碱基转换/颠换比值(TS/TV)为2.79;平均核苷酸差异数、核苷酸多样性、单倍型多样性及单倍型数分别为2.923、0.00577、0.911、29;AMOVA分析揭示群体间遗传分化高于群体内分化;基于D-loop区构建的进化树,多数个体没能按照采样点进行聚类。研究表明,弓背青鳉线粒体COⅠ基因比D-loop区具有更快的进化速率,更适合用于弓背青鳉的遗传多样性与遗传分化研究。根据COⅠ基因和D-loop区序列检测群体遗传多样性的结果,中国南海沿海群体的遗传多样性处于较低水平,需要采取适当的保护措施。