尼罗罗非鱼是世界性的养殖鱼类，也是研究性别决定与分化的好材料。本研究利用罗非鱼孵化后5、30、90、180天XX和XY罗非鱼性腺以及人工投喂Letrozole诱导3月龄雌性罗非鱼性逆转过程所测转录组数据分别建立数据库，结合罗非鱼基因组测序结果，开展了转录组学研究。通过NCBI上的本地BLAST软件对一些重要的基因或基因家族，比如FOX、SOX、WNT、FGF、GATA、DM、NR家族基因和类固醇合成酶基因、减数分裂相关基因以及蛋白质合成相关基因进行系统的分析，分析结果表明，这些基因家族中的许多基因在罗非鱼性腺中的表达具有明显的性别二态性，并且其表达模式随罗非鱼的性逆转而转变，暗示这些基因家族中的这些成员很可能对罗非鱼的性别决定和分化以及性逆转具有重要的作用。将转录组数据和基因组序列对应起来也为发现一些迄今在硬骨鱼类甚至其他脊椎动物尚未被报道的新基因或复制基因，以及一些已知基因尚未报道的新选择性剪切形式提供了便利。