牛全基因组预测转录因子数据库

来源 :中国畜牧兽医学会信息技术分会2008年会学术研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wugenkuaizi
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DCTF利用HMMER在全基因组范围内预测了牛(Bos taurus)5479个预测转录因子,这些转录因子一共涉及了64个蛋白质家族。所收录数据是非冗余的。同时DCTF还包含每个转录因子所涉及的注释信息:序列特点,功能结构域,3D结构,转录信息以及QTL注释信息。在本数据库为2174个转录因子注释了QTL信息和表型性状信息。
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