【摘 要】
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真核生物基因组中LTR反转座子是最重要的转座子类型,它通过大量复制改变基因的功能或重构基因组.有些LTR反转座子偏爱性地插入到其它的LTR反转座子中,但组成这些嵌合型转座子的原因和进化意义尚不清楚.本研究中,我们从1.52Gb的芸薹属序列中,寻找到6个高度富集LTR转座子的BAC.其中,4个BAC的LTR转座子形成主要是自我复制,少数来源于外源转座子的插入.通过Genescan软件分析,共预测到2
【机 构】
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西南大学农学与生物科技学院,重庆油菜工程研究中心,重庆,400716 豆科植物研究中心,农业与食品
【出 处】
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中国作物学会油料作物专业委员会第七次会员代表大会暨学术年会
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真核生物基因组中LTR反转座子是最重要的转座子类型,它通过大量复制改变基因的功能或重构基因组.有些LTR反转座子偏爱性地插入到其它的LTR反转座子中,但组成这些嵌合型转座子的原因和进化意义尚不清楚.本研究中,我们从1.52Gb的芸薹属序列中,寻找到6个高度富集LTR转座子的BAC.其中,4个BAC的LTR转座子形成主要是自我复制,少数来源于外源转座子的插入.通过Genescan软件分析,共预测到207个基因,转座子插入到基因中,使大多数基因失活.另外,丰富的SSR存在于LTR-TEs区域内,5个BAC被推测为位于异染色质区域,SSR和LTR转座子在着丝粒的形成过程中起着重要的作用.结论:LTR转座子自我复制,重复插入,抑制基因的活性,并形成着丝粒区域.
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