【摘 要】
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目的:比较COI、Cytb、16srRNA、D-loop四个DNA条形码对黄毛鼠鼠种的鉴定效果. 方法:将大榭港区捕获的1例黄毛鼠样本HX41,提取基因组DNA,使用特异性引物对线粒体COI、Cytb
【机 构】
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大榭出入境检验检疫局鼠传疾病检测实验室,大榭宁波315812
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目的:比较COI、Cytb、16srRNA、D-loop四个DNA条形码对黄毛鼠鼠种的鉴定效果.
方法:将大榭港区捕获的1例黄毛鼠样本HX41,提取基因组DNA,使用特异性引物对线粒体COI、Cytb、16 srRNA、Dloop基因进行扩增并对扩增产物进行测序.将测序结果与GenBank中的相似鼠种DNA构建分子进化树进行同源性分析.
结果:以COI 、Cytb、D-loop基因所构建分子进化树中,黄毛鼠均能独立形成分枝,且HX41均处于黄毛鼠分枝上.HX41的COI基因序列与黄毛鼠HN158株遗传距离最为接近,值为0.0034;Cytb基因序列与黄胸鼠HN99株遗传距离最为接近,值为0.0355,但HN99鼠种数据存在错误;D-loop基因序列与黄毛鼠HN105株遗传距离最为接近,值为0.0439.由于现有Genbank中缺少黄毛鼠16srRNA基因序列,无法构建进化树.
结论:对鼠种进行分子鉴定时,有必要根据GenBank数据库的完整性和准确性选择合适的DNA条形码.
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