褐点石斑鱼(Epinephelus fuscoguttatus)又称棕点石斑鱼、老虎斑,是辐鳍鱼纲、鲈形目、鲈亚目、鮨科、石斑鱼亚科、石斑鱼亚属的一个物种,为暖水性岛礁鱼类.分布于红海、印度洋非洲东岸至太平洋,在我国主要分布地东海和南海,由于其味道鲜美、蛋白质品质高,近年来已广东、海南等南方沿海省市的重要经济鱼类.同时老虎斑也是雌雄同体先雌后雄鱼类,对其进行全基因组测序,和功能基因组的研究,有助于阐明其特殊生物学性状.我们选取一条成年雌性褐点石斑鱼进行全基因组从头测序.从褐点石斑鱼血液中提取DNA并构建三个不同插入片段长度的测序文库.其中,paired-end文库两个、平均插入片段长度为400bp,mate-pair文库两个、插入片段平均长度分别约2Kb和9Kb.作用Illumina 2000测序仪测序,得到总测序量约160GB,测序深度约150倍.使用Soapdenovo (K-mer=75)和fermi对reads进行组装,得到基因组序列1.13G,其contig N50长度为44 Kb,scaffold N50为841Kb.从基因组序列中预测得到protein-coding的基因23963个.利用斜带石斑鱼(Epinephelus coioides)氨基酸序列对预测基因进行blast验证,比对显示92.4％(22139)的基因覆盖率在60％以上.同时,从转录组序列在基因上的覆盖率看,大部分基因的转录组序列覆盖率在50％以上.褐点石斑鱼基因组序列的构建对于解析石斑鱼性别逆转、生长、生殖发育等性状的分子机制具有重要意义,也为石斑鱼良种分子育种和鱼类性别决定机制的深入研究提供了宝贵的遗传资源.