新定量PCR数据处理方法的理论探讨

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目的讨论利用荧光标记探针技术及PCR动力学数学模型建立更加准确的定量PCR方法的可行性。方法根据PCR动力学数学模型提供的数学方程开发使用定量PCR仪器获得的数据做定量PCR分析的方法,分析计算结果的准确性。判断建立更加准确的定量PCR方法的可能性。结果通过一些数据的分析表明,使用模拟定量PCR仪器的数据利用PCR动力学数学模型提供的数学方程可以获得比目前使用CT值的方法更加精确的定量结果。分析误差可达1%以下。讨论日新月异的生命科学技术的发展及临床医学科学研究的需求,一般的PCR技术已远远不能满足工作的需要。PE公司在进行了大量的PCR动力学研究的基础上,发现了利用荧光标记探针在PCR循环过程中积累的荧光强度达到仪器检出阈值时,系统的初始模板数量与循环次数之间有线性关系,据此建立了目前的PE 7700及PE 5700仪器的定量PCR技术。开创了PCR技术的新局面。但是由于这一技术的误差较大尚不能满足生命科学技术及临床医学科学研究的需求。因此需要研究新的定量PCR技术。PCR动力学数学模型是根据PCR技术的原理。综合了科学家在相关领域中取得的研究成果,认真分析了PCR反应体系中主要反应成分间的分子数量关系的基础上提出的,能够准确描述PCR反应产物分子数量积累规律的动力学方程。根据PCP反应的原理建立的PCR动力学数学模型,给出了PCR产物数量或者荧光强度与初始模板数量及其它反应条件间的函数关系。利用这一关系根据PCR反应已积累的产物数量,可以实现准确的定量PCR分析,得到初始模板数量达到定量PCR的目的。使用动力学数学模型做定量PCR分析,分析结果的误差仅与使用的荧光强度数值的精确度相关,或者说与测定仪器的准确性有关。使用精确到6位数的荧光强度数据,模板数自500—1000000区间定量结果的准确性可达99%以上。同样的设备一样的仪器,分析方法水平的差异导致分析结果的误差是有明显差异的。本文根据模拟实验数据进行了初步的定量PCR分析,分析结果是令人鼓舞的。同时指出目前的定量PCR仪器改用PCR动力学模型处理分析数据,定量分析的结果会比目前的C_T值方法在准确性方面提高80倍以上,可以满足各方面研究工作误差水平的需要。
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