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目的 在孟德尔遗传的神经系统遗传病中，共济失调毛细血管扩张症(AT)、舞蹈病-棘红细胞增多症(ChAc)、杆状体疾病(NM)、Joubert综合征(JS)等罕见的常染色体隐性遗传性神经肌病的分子诊断一直以来是应用经典的分子遗传学方法，包括多聚酶链式反应(PCR)和DNA测序(Sanger Sequencing)等.近年来二代测序技术(NGS)发展迅速，因其高通量、高性价比的特点，较传统的测序技术有明显的优势.本研究旨在探讨NGS技术在罕见的常染色体隐性遗传性神经肌病分子诊断中的应用价值.方法 本研究对6个AT家系和1个ChAc家系的先证者应用目标区域捕获测序技术(TRS)进行测序，对发现的点突变应用Sanger测序进行验证，对发现的拷贝数变异(CNV)应用实时荧光定量PCR(RT-PCR)进行验证；对1个NM家系和1个JS家系的先证者应用外显子组测序(WES)进行测序，对发现的点突变应用Sanger测序进行验证.结果 本研究完成了上述家系的分子诊断，发现了一系列的突变，其中：在AT家系中发现了致病基因ATM的以下复合杂合突变：[c.5697C＞A+exon 62-63del]、[c.477_481del ATCTC+c.4777-2A＞T]、[c.3078G＞T+c.7983_7985delTGT]、[c.72G＞A+c.985_989delAGAGG]、[c.5293 C＞T+c.1402_1403 delAA]、[c.1402_1403delAA]；在ChAc家系中发现了致病基因VPS13A的1个c.9403C＞T的已知的纯和突变；在NM家系中发现了致病基因NEB的1个[c.1015 G＞A+c.9052G＞A]的复合杂合突变；在JS家系中发现了致病基因CC2D2A的1个[c.2999A＞T+c.3688C＞T]的复合杂合突变.结论 本研究首次提出了应用NGS技术进行罕见的孟德尔遗传的神经系统遗传病分子诊断的概念和策略.首次应用NGS技术完成了多种罕见的常染色体隐性遗传性神经肌病的分子诊断；证实了NGS技术在诊断罕见的常染色体隐性遗传性神经肌病(特别是具有明显遗传异质性时)中具有明显的优势.