【摘 要】
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本实验建立了一种提取鱼肠道微生物DNA的新方法(CLU),此方法高效,经济且简单.CLU法与氧化锆珠破壁法(ZBC)及Qiagen试剂盒(QIA)两种方法同时提取锦鲤肠道微生物DNA,并通过琼脂糖凝胶电泳及16S rDNA高通量测序进行检测及比较.在方法CLU中,将溶菌酶与超声波结合分离基因组DNA,且首次将溶菌酶的孵育温度提高到60℃.琼脂糖凝胶电泳表明CLU法和QIA法可得到单一清晰的DNA条
【机 构】
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天津农学院水产学院,天津市水产生态及养殖重点实验室,中国天津300384
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本实验建立了一种提取鱼肠道微生物DNA的新方法(CLU),此方法高效,经济且简单.CLU法与氧化锆珠破壁法(ZBC)及Qiagen试剂盒(QIA)两种方法同时提取锦鲤肠道微生物DNA,并通过琼脂糖凝胶电泳及16S rDNA高通量测序进行检测及比较.在方法CLU中,将溶菌酶与超声波结合分离基因组DNA,且首次将溶菌酶的孵育温度提高到60℃.琼脂糖凝胶电泳表明CLU法和QIA法可得到单一清晰的DNA条带；方法ZBC法得到的DNA虽降解严重,但得率高.16S rDNA高通量测序结果表明,CLU法所提取DNA鉴定出的OUT数目显著高于其他两种方法.α-多样性指数表明CLU法提取的DNA生物多样性最高,QIA法最低.ZBC法与QIA法间的微生物组成结构与CLU和ZBC间,或CLU与QIA间相比,更加相似.
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