花菜类作物包括青花菜、花椰菜和芥蓝等,营养丰富,尤其是含抗癌物质莱菔子苷等,具有非常重要的经济价值。传统的育种方式对其产量及品质的改良幅度已不能满足生产需要。本研究中通过遗传多样性和群体结构分析,确定材料的遗传背景以及材料间的亲缘关系,为后期青花菜、花椰菜和芥蓝育种工作中的亲本选配提供有益的参考,同时挖掘与优良性状相关的等位基因资源以及通过分子标记辅助选择提高育种效率、加快育种进程。利用SSR标记,选用4l对带型清晰的多态性引物,对145个青花菜、花椰菜和芥蓝品种和资源材料进行遗传多样性分析。共检测到274个多态性位点,每组合的多态性条带数从3~17之间,平均为7.0。利用NTSYS-pc 2.10e软件采用Jaccard’s相似系数和UPGMA方法进行聚类分析。结果表明,通过群体遗传结构分析将供试材料分为4个亚群。大部分具有亲缘关系的品种依青花菜、花椰菜(松花型)、花椰菜(紧花型)、芥蓝各聚为一类群,其结果与花菜形态学分类具有高度的相符性;145个品种的平均遗传相似系数为0.77,变化范围在0.59~0.99之间,青花菜、花椰菜(紧花型)、芥蓝品种间的平均相似系数均为0.81,花椰菜(松花型)为0.88,类群内品种间的遗传多样性较低。以GLM分析,发现28个与熟性相关联的标记,各标记对表型变异的解释率在0.0418~0.2108;以MLM分析,发现8个与熟性相关的标记,各标记对表型变异的解释率在0.0415~0.0732。这些标记主要位于C2、C5和C9染色体。