复发性子宫平滑肌肉瘤外显子组突变分析

来源 :第八届中国肿瘤学术大会暨第十三届海峡两岸肿瘤学术会议 | 被引量 : 0次 | 上传用户:huangzhongyan22
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:子宫平滑肌肉瘤复发率高,且复发后再次手术难度大,对放化疗欠敏感是棘手的妇科肿瘤疾病.通过对复发性子宫平滑肌肉瘤外显子组突变分析寻找可能参与肿瘤复发突变缺失基因,寻找可能用于后续靶向治疗潜在靶点,帮助阐明平滑肌肉瘤复发的分子机制. 方法:收集本院手术的复发性子宫平滑肌肉瘤3例,其中两例为肿瘤组织、以及肿瘤周围正常组织,一例肿瘤组织,以外周血为对照(无肿瘤周围组织)。抽提基因组DNA,采用Illumina truseq DNA样本制备试剂盒建立文库,采用Hsiq2500进行测序,目标区域测序深度57X-90X,比对上的reads 98.50%~98.85%,覆盖度89.03%~90.81%,平均89.20%区域测序深度大于4x,平均86.75%区域测序深度大于l0x。采用BWA等比对软件对测序进行包括SNP分析、插入/缺失、拷贝数变异以及G0功能分析、KEGG生物通路分析等。 结果:外显子组测序比对发现在三例复发性子宫平滑肌肉瘤中平均体细胞SNP 170500平均体细胞突变7120位点,COSMIC中含有的癌症相关突变2797个),其中如CDK11A,NOC2L,ATAD3B,GO功能分析显示突变基因功能位于纤维蛋白降解过程中等。KEGG生物通路分析显示突变基因参与了络氨酸代谢、脂肪酸合成、0-糖原合成,赖氨酸降解。 结论:外显子组测序分析帮组了解复发性子宫平滑肌肉瘤外显子体细胞基因突变全貌,提示纤维蛋白降解、络氨酸代谢、脂肪酸合成、0-糖原合成,赖氨酸降解等过程可能与肿瘤进展相关。
其他文献
Severalkeytechniquesinhigh speedopticaltimedivisionmultiplexing (OTDM )systems,in cludingthe generationandcompressionof gain switche? Severalkeytechniquesinhigh speedopticaltimedivisionmultiplexing (OTDM) systems, in cludingthe generationandcompressionof
期刊
2009年2月20日上午,自治区召开地方志工作视频会议。崇左市市长黄克,市委常委、副市长冯学军及市地方志编纂委员会成员、市直各单位分管领导在崇左分会场出席会议。主会场会
请下载后查看,本文暂不支持在线获取查看简介。 Please download to view, this article does not support online access to view profile.
期刊
目的:检测子宫内膜癌中ER、PADI4、P53表达情况,探讨其在子宫内膜癌临床病理分期中的意义. 方法:采用免疫组化法检测正常子宫内膜、不典型增生子宫内膜及子宫内膜癌组织中ER
会议
目的:使用蛋白组学及代谢组学技术研究卵巢上皮癌多药耐药患者血清中差异表达的蛋白质及代谢化合物,寻找卵巢上皮癌多药耐药相关的诊断标志物及探索多药耐药的发病机制,进而找
会议
目的:研究显示放疗抵抗的宫颈癌细胞中富含表达CD44+/CD24+的细胞,本研究旨在探讨是否放疗抵抗的细胞和CD44+/CD24+表达阳性的细胞均具备肿瘤干细胞特性. 方法:通过多次分割
会议
東史小学去年有畢業生三十三人,除了考取中學和回小學補習的以外,其餘都參加了勞動生產。其中參加農業生產的有二十一人,他們在農業生產及互助合作運動中發揮了很大的作用。
英国《每日电讯报》近日公布了一组照片,展现了水滴溅落水面一刹那的神奇画面,这一系列图片都是由摄影师科里·怀特拍摄而成的。1、水花飞碟摄影师科里·怀特用吸管将带有彩
上学期中,由於陰雨連綿,水位增高,因此低窪之地,積水很深,行路甚感困難。在這樣的情况下,我們是這樣注意兒童的安全問题的: 1、提高教師的思想認識,加强對兒童全面負責的精
经过多年实践,我总结了番茄雄蕊退化型不育系的新的保种技术,现介绍如下: 一、环境条件的调控番茄雄蕊退化型不育系,在正常条件下,其雄蕊虽已退化,但花药内尚有少量花粉,可