基于16S rRNA基因部分序列的长江口虾虎鱼科鱼类系统分类

来源 :2015年中国水产学会学术年会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:ununszeto
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  为了确定线粒体16S rRNA 基因在长江口虾虎鱼科鱼类系统分类及物种鉴定中的作用,本研究采用16S rRNA 基因特异扩增测序及GenBank 已有序列联合配对分析的方法,对长江口虾虎鱼科9 属11 种鱼类34 个16S rRNA 基因片段的序列进行比较和系统分类研究.结果显示,虾虎鱼科鱼类该片段的A 含量明显高于其他3 个碱基含量,A+T 的平均含量高于G+C 的平均含量;全部转换位点多于颠换位点,转换/颠换比值为1.45;11 种虾虎鱼科鱼类种间遗传距离平均值为0.151,种内为0.002,种间遗传距离是种内遗传距离的76 倍.NJ 树显示长江口虾虎鱼科鱼类为明显的单系群,并进一步佐证把传统形态分类中弹涂鱼科的青弹涂鱼和大弹涂鱼及鳗虾虎鱼科的拉氏狼牙虾虎鱼和红狼牙虾虎鱼归属于虾虎鱼科的合理性.红狼牙虾虎鱼和拉式狼牙虾虎鱼聚为一支,其节点支持率达100%,两者可能为同种异名.本研究表明,线粒体16S rRNA 基因序列作为分子标记对虾虎鱼科鱼类进行物种鉴定和系统分类是可行的,可为虾虎鱼类的亲缘关系分析提供基础资料.
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