辣椒环斑病毒的基因组测序与分析

来源 :2011年度中国热带作物学会遗传育种专业委员会年会暨学术研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:jushicahgn
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  辣椒环斑病毒(chiRSV)是马铃薯Y病毒属的一个新成员,最近它于中国海南以较高的检出率被检测到。除poly(A)尾,本实验测序得到海南分离物ChiRSV-HN/14的基因组序列(GeneBank登陆号为JN008909)长度为9571个核苷酸(nt),其中包含一大一小两个开放阅读框(ORF)。大的0RF包含9240个核苷酸,编码一个由3079个氨基酸聚合而成的多聚蛋白,其分子质量为349.1 kDa:小的ORF即PIPO,在基因组上的位置是2913—3095 nt,编码一个包含60个氨基酸的肽段。chiRSV与同属内其它病毒在核酸和氨基酸水平上的最同源性分别为48.5-65.4%和42.9-68.7%,系统进化树分析进一步表明ChiRSV是马铃薯Y病毒属内一个独立的种。ChiRSV-HN/14与烟草脉带花叶病毒(TVbMV)以及同属内其它两种侵染辣椒的病毒的亲缘关系最近。
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