从东北大兴安岭林区的4个地区采集了7种石蕊属地衣:黑穗石蕊Cladonia amaurocraea、正硫石蕊Cl.deformis、分枝石蕊Cl.furcata、喇叭石蕊Cl.pyxidata、宽杯石蕊Cl.rappii、石蕊Cl.rangiferina及粗皮石蕊Cl.scabriuscula等。用去除皮层法对其进行了内生真菌的分离培养,结合培养特征和分子序列(nr ITS)对其进行了鉴定。结果显示:从7种15份石蕊属地衣体的710个组织块中共分离培养获得90个菌株,平均定殖率为12.68%(2.86~32.76%)。根据分离的内生真菌的菌落特征、菌丝形态进行归类选择30个菌株测定其ITS序列,经比对和构建系统发育树分析,确定获得的内生真菌分属于子囊菌门、担子菌门及接合菌门中的4纲9目12科15属。Xylariaceous的菌株为优势类群,占全部菌株的62.22%,正硫石蕊及石蕊外的其余5种地衣均获得了该类菌株,最常见的种类为Hypoxylon fuscum。同一地区不同种地衣内生真菌分布有一定差异,不同地区同一种地衣内生真菌的分布亦呈现一定差异,表明石蕊属内生真菌具有丰富的生物多样性,但无明显的宿主专一性和地区专一性。接合菌门Mucorales目Umbelopsidaceae科Umbelopsis属的菌株只从着生于腐木上的正硫石蕊中分离得到,也是该种地衣中分离获得的唯一内生真菌。担子菌门伞菌纲Polyporales目Polyporaceae科Coriolopsis属的菌株只来源于石蕊,而从该种中同时分离获得了属于子囊菌门粪壳菌纲的内生真菌。